当教会の牧師は、中島和喜(なかじまかずき)。2023年4月に、この教会に着任しました。
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なお、これまで函館教会の伝道を担われたのは以下の牧師･宣教師です。
<主任牧師> <協力宣教師>
- 1949-50年V.サオライネン宣教師(準備)
- 1950-52年 田村均氏(現地責任者) 1950-52年P.サオライネン宣教師(出張)
- 1952-57年 和田英男牧師 1952年- T.ワルトネン宣教師(出張)
- 1957-62年 河島与施夫牧師
- 1962-66年 日野俊夫牧師 1965-67年P.サオライネン宣教師
- 1966-69年 森武夫牧師
- 1969-72年 竹内正一牧師
- 1972-82年 武村協牧師 1975-80年W.エリクソン宣教師
- 1981-85年S.ステンバーグ宣教師
- 1982-90年 田中博二牧師 1985-88年P.フフティネン宣教師
- 1990-95年 和田英男牧師
- 1995-98年 山之内正俊牧師
- 1998-03年 東和春牧師
- 2004-10年 ピリピ・ソベリ牧師(08-10年は牧会委嘱)
- 2010-16年 坂本千歳牧師
- 2016-19年 小山茂牧師
- 2019-23年 小泉基牧師
- 2023年- 中島和喜牧師